C'est ainsi que de 1961 à 1989, le C.S.M. surveilla la radioactivité de l'atmosphère et utilisa le carbone radioactif naturel et artificiel comme traceur des grands courants océaniques et comme indicateur de paléontologie.

De même, dans la tradition des études océanographiques et de biologie marine, le C.S.M. a apporté de précieuses contributions à l'évaluation des temps de résidence des eaux profondes en Méditerranée, à l'étude des transferts de polluants et d'organismes dans les détroits de la Méditerranée, à la modélisation de la circulation des eaux côtières, au devenir des polluants bactériens en mer, aux effets des surcharges en éléments nutritifs sur les cycles naturels.

Il a montré, en collaboration avec les laboratoires du C.N.R.S. de Marseille, les capacités d'adaptation de l'activité des cellules nerveuses de mollusques marins et a participé activement à la mise au point par le laboratoire d'Océanographie physique du Muséum d'Histoire Naturelle de Paris, de flotteurs suivis par satellites Argos pour étudier les grands courants marins dans l'Atlantique et le Pacifique.